Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpcn1Q9EQJ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms