Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms