Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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