Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms