Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms