Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc1Q9EP53 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms