Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms