Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf6Q9DBU5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf6Q9DBU5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf6Q9DBU5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf6Q9DBU5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms