Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms