Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms