Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms