Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms