Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl40Q9D783 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms