Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc3Q9D6Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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