Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms