Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm5Q9D6G9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms