Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms