Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rab11fip1Q9D620 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rab11fip1Q9D620 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rab11fip1Q9D620 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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