Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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