Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms