Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms