Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms