Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk3Q9D2E1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk3Q9D2E1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms