Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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