Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms