Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx56Q9D0R4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddx56Q9D0R4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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