Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift27Q9D0P8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ift27Q9D0P8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ift27Q9D0P8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ift27Q9D0P8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ift27Q9D0P8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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