Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpsap1Q9D0M1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms