Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms