Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms