Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms