Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc1Q9CWW7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc1Q9CWW7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms