Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CWU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms