Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddx28Q9CWT6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddx28Q9CWT6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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