Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms