Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms