Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms