Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms