Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms