Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nicn1Q9CQM0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms