Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms