Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms