Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms