Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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