Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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