Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl17Q9CPR4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms