Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt23Q99PS0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms