Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms