Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms