Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms